Povprečna vsebnost molibdena v zemeljski skorji je približno 0,00011 %. Odkritih je bilo približno 20 vrst molibdenovih mineralov, med katerimi je molibdenit industrijsko najbolj dragocen, sledijo pa mu kalcijeva ruda volframove-faze, železova platinova ruda, molibdenit in platinova-bakrova ruda. Po podatkih, ki jih je leta 2015 objavil Geološki zavod Združenih držav, znašajo svetovne zaloge molibdena približno 11 milijonov ton, dokazane zaloge pa približno 19,4 milijona ton.
Regionalna distribucija
Svetovni viri molibdena so predvsem skoncentrirani vzdolž vzhodnega roba pacifiškega bazena, v Andih, ki se raztezajo od Aljaske in Britanske Kolumbije prek Združenih držav in Mehike do Čila. Najbolj znano je gorovje Cordillera v Ameriki, kjer so številna nahajališča porfirnega molibdena in bakra. Sem spadajo Clemensk in Hendersonova nahajališča porfirnega molibdena v ZDA; nahajališča El Teniente, Chuquicamata, El Salvador, in Tespidarca porfirska nahajališča bakra-molibdena v Čilu; in nahajališča porfirja bakra-molibdena Endaco in Highland Valley v Kanadi. Kitajska se ponaša tudi z bogatimi zalogami molibdena, saj province Henan, Shaanxi in Jilin predstavljajo 56,5 % vseh zalog v državi.
Nacionalna distribucija
Po podatkih, ki jih je leta 2015 objavil ameriški geološki zavod, znašajo svetovne zaloge molibdena približno 11 milijonov ton. Kitajska je z viri molibdena najbogatejša država na svetu s 4,3 milijona ton, sledijo ji ZDA (2,7 milijona ton) in Čile (1,8 milijona ton). Te tri države skupaj predstavljajo približno 80 % svetovnega zneska. Druge države z razmeroma bogatimi viri molibdena so Peru (450.000 ton), Kanada (260.000 ton), Rusija (250.000 ton), Avstralija (200.000 ton), Mongolija (160.000 ton), Armenija (150.000 ton), Mehika (130.000 ton), Kazahstan (130.000 ton), Kirgizistan (100.000 ton), Turčija (100.000 ton), Uzbekistan (60.000 ton) in Iran (50.000 ton). Distribucija na Kitajskem
Kitajska je ena izmed držav z najbogatejšimi viri molibdena na svetu. Po podatkih, ki jih je objavilo ministrstvo za zemljišča in vire, so ob koncu leta 2013 kitajske dokazane rezerve molibdena znašale 26,202 milijona ton (vsebnost kovin). Leta 2014 so se kitajske dokazane rezerve molibdena povečale za 1,066 milijona ton (vsebnost kovin), tako da so skupaj znašale 27,268 milijona ton (vsebnost kovin). Poleg tega je Kitajska od leta 2011 odkrila tri nova 2-milijonska nahajališča molibdena, vključno z enim v Shapinggouju v provinci Anhui, s čimer je dodatno utrdila svoj položaj države z največjimi viri molibdena na svetu.
